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棉籽經過剝殼機分離，棉仁用于榨油，剩下的外殼就是棉籽殼，也稱棉皮。根據剝殼機械的類型不同、棉花籽品種不同、產地不同、含水量不同、剝殼后碎棉仁粉過篩程度不同等。加工出來的棉籽殼的大小、顏色、棉絨長度、營養成份（含棉仁粉）也不一樣。 棉籽殼主要用于：養殖食藥用菌、作為飼料、牲畜飼養等。
籽棉經過軋花機加工去除棉籽而得到皮棉，棉籽經過削絨機加工得到一道、二道、三道等短絨。削絨次數越多棉籽殘留棉絨就越少此時棉籽稱“光籽”反之殘留棉絨多的稱“毛籽”。光籽產的棉殼大都是小（少）絨殼或“鐵殼”鐵殼棉仁粉少的棉殼纖維素含量少而適用于栽培木腐菌；絨多棉仁粉多的棉殼纖維素含量多而適用于栽培草腐菌。棉籽殼被稱為食藥用菌的 培養基。
棉籽殼行內通常分為大、中、小殼或以棉絨量大小而分為大絨殼、中絨殼、小絨殼、絨極少的甚至稱為“鐵殼”。含絨量的多少取決于原料棉籽脫短絨時而定，如棉短絨行情價高暢銷，廠商便會盡量多削去短絨。食用菌栽培中棉殼的大小就產量而言沒有太大的差別。因為很多油廠產出大殼后加以粉碎便成了小殼以適應栽培要求。主要反映在食用菌栽培過程中會有裝袋密度大小的技術性要求：小殼裝袋密度太大會出現發菌通氣不良；而大殼裝袋時亦易使栽培袋破損。
在原料棉籽正常含水量同等時棉殼的顏色通常能看出棉殼質地好壞：如顏色發白（干枯樣）、手握緊有刺痛感、無或只有極少量碎棉仁粉是由于追求高出油率而使用的剝殼機（特別是新型機器）破殼時棉仁粉碎率很低，至使含粉量低，當然影響顏色還有棉籽加工時的溫度、工藝、過篩、以及破殼后存放的水份有關。此類棉殼西北部產量較多，新型機器加工的大型油廠基本都是。這種棉殼營養成份含量最差、價格低，適合種植木腐菌類。反之顏色呈棕褐、黃色等手握有棉絨軟感、油膩感、碎棉仁粉多、用水適量搓洗水呈米湯色、乳白色等濃稠狀，說明棉殼營養成份含量極高，相應出油率就低！通常是老式（磨盤）機器生產，此種棉殼長江流域、河南省等產區較多。價格普遍較高，適合種植草腐菌或要求營養成份高的菌類。
