多肽合成是一個固相合成順序順序一般從C端(羧基端)向N端(氨基端)合成。過去的多肽合成是在溶液中進行的稱為液相合成法。從1963年Merrifield發展成功了固相多肽合成方法以來，經過不斷的改進和完善，到今天固相法已成為多肽和蛋白質合成中的一個常用技術，表現出了經典液相合成法無法比擬的優點，從而大大的減輕了每步產品提的難度。多肽合成總的來說分成兩種：固相合成和液相多肽合成。
多肽合成技術
Merrifield首次提出了固相多肽合成方法(SPPS)以來，此技術的優勢受大眾青睞，所以目前大眾比較長使用的多肽合成技術手段就是固相合成技術。固相合成肽技術是液相合成肽技術的升華。液相合成技術，也可進行多肽的合成，通常此方法會導致消旋的副反應，或在強堿存在時形成5(4H)-oxaylones和N-acylurea而受到影響。慶幸地是，這些副反應能小化，但是還不能完全消除。
固相多肽合成原理
1963年，Merrifield提出了固相多肽合成方法，由于其合成方便，迅速，成為多肽合成的方法，而且帶來了多肽有機合成上的一次革命，并成為了一支獨立的學科——固相有機合成，固相合成的發明同時促進了肽合成的自動化。
例如，國肽生物多肽合成主要是采用Fmoc合成法。Fmoc合成法采用Fmoc為α-氨基的保護基，側鏈保護采用芐醇類。合成時將一個Fmoc－氨基酸衍生物共價交聯到樹脂上，用堿脫除Fmoc，用三乙胺中和游離的氨基末端，然后通過DCC活化、偶聯下一個氨基酸，脫保護多采用HF法或TFMSA（三氟甲磺酸）法。
多肽合成服務種類
多肽合成服務通常有線性肽合成服務、多種難肽合成服務、修飾肽合成服務、以及部分多肽合成公司還會提供多肽定制服務，定制出有針對性的合成肽。
目前有多肽合成公司提供的線性肽合成可達150個氨基酸，在修飾肽合成上，能提供常見修飾，磷酸化（Ser/Thr/Tyr），環化（酰胺環/二硫鍵環），熒光標記（5(6)-FAM，FITC，CY5，RhodamineB，PNA，EDNAS/dabcyl等），生物素標記（Biotin，Lys(Biotin)）/復合抗原（MAP）/含D型氨基酸,及各種氨基酸衍生物均可合成。
多肽產物度選擇
常見的質譜級多肽度，一般要求
